問い合わせ内容との便宜上、名前を１２３４とさせていただきます。

題名のように簡易BBSEX v1.30を利用していますが、クッキーから読み出したunameが文字化けしてしまいます。
１２３４→?P?Q?R?S
「$in{'uname'}」も「$ENV{'HTTP_COOKIE'}」も表示させてみましたが、「uname:」から「,」まで文字化けしていました。
当方ではIE6SP1を使用していますが、IE6SP1のCOOKIEファイルは正常に１２３４が記入されています。
また、Operaにて表示したときも同様でした。

環境情報(詳細)
OS:Window 2000 Pro　SP4(サーバとクライアントは同じです)
HTTPd:Apache/2.0.48
Browser:IE6SP1, Opera7.23J(Proxyなし)
Perl 5.6.1

解決しました。
お騒がせしました。
http://www.futomi.com/lecture/cookie/

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$COOKIE{'uname'} =~ s/%([0-9a-fA-F][0-9a-fA-F])/pack("C",hex($1))/eg;

#--- 入力 ---#
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と
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		$cookiefixed_uname = $in{'uname'};
		$cookiefixed_uname  =~ s/([^\w\=\& ])/'%' . unpack("H2", $1)/eg;
		print "Set-Cookie: $ENV{'SCRIPT_NAME'}=uname:$cookiefixed_uname\,email:$in{'email'}\,tm:$in{'tm'}\,passwd:$in{'passwd'}; path=$path; expires=$date_gmt\n";
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を修正しました。