超初心者な質問で申し訳ありません。
データアップ（画像やPDFなど）ができるCGIにアクセス制限（しかもユーザー毎に違うIDとパスワード）をかけたところ、予測通りデータをアップした際にエラーとなり書き込めませんでした。
基本的に絶対無理なことなのでしょうか？
どうしてもアクセス制限をかけたい場合は簡易なもの（JAVAなど）しか方法はないのでしょうか？

自己レスです。
今回はとりあえずCGIを設置したディレクトリ全体ではなく部分的に
（最初に起動する部分だけ）にアクセス制限をかけることで一応入室時には
アクセス制限がかかるがデータアップ時にはかからない形で落ち着きました。
この方法が正しいのかどうか、他の構成のデータアップCGIの時はどうすれば
良いのかという最終的な結論にはいたっていませんが・・・
またいつかこの疑問に答えてくださる方が現れることを期待しています。