はじめまして。
実はCGI起動時に登録をした時点で登録者専用の保存用ディレクトリの作成は上手くいくのですが、ファイルが保存されていると削除が出来ません。

ちなみに空の時は『rmdir("$basedir");』実行で消せます。

これを単に『rm -r ("$basedir");』と書き換えただけではCGIがエラーになってしまい上手くいきません。
どうしたらいいでしょうか？よろしくお願いします。

`rm -rf $basedir`;
or
system("rm -rf $basedir");

さっそく試してみたところ上手く削除する事が出来ました。
数日の悩みがウソのようにほぐれました。ほんとうにありがとうございましたm(_ _)m