時間帯によって異なる画像を表示させるjavascriptを
参考にさせてもらったのですが、
画像は変化する事は出来るのですが、それぞれの
画像にリンクを貼りたいのです。
色々やって見ましたが出来ませんでした。
初心者なのでよろしくお願いします。

http://www.rescue.ne.jp/CGI-BBS/javas/javascript/20060310161803.shtml
を参考にすると、画像のurlを変化させるように、
リンク先url（つまりはAタグのhref）も変化させれば出来ます。
document.write('<a href="'+A+'"><img src="'+B+'" alt="代替テキスト"></a>');
のようにして、変数AとBを変化させておけばいいわけです。